MyMBGD
- ヘッダー条件
- #で始まる
- 項目ごとにカンマ(,)、もしくは、半角スペースで区切られていること
- 受け入れ可能項目(*必須項目)
ヘッダー名 | 必須項目 | 説明 | データ |
id/locus_id | * | 遺伝子のID | 1_1 |
name | | 遺伝子の名前 | geneA |
from | * | 遺伝子の開始位置 | |
to | * | 遺伝子の終了位置 | |
dir | * | 遺伝子の向き | 1/-1/F/R/DIR/INV |
type | | 遺伝子のタイプ | CDS |
descr | | 遺伝子の説明 | |
chrid/chr_acc | | 染色体のID | chr1 |
- データ条件
- データの区切り文字はタブとする
- 必須項目は下記
- id/locus_id *
- from *
- to *
- dir *
- ヘッダーを付けない場合は下記の順番とする
- 7カラムの場合
id, name, from, to, dir, type, desc
- 6カラムの場合
id, name, from, to, dir, desc
- chridがあればchromosome情報があるとみなす
- idのデータは重複してはならない
- アミノ酸配列しかない場合は、from=-1, to=-1を指定する
- idとgeneのfastaファイルのidは対応したものを記載する
- chridとchromosomeのfastaファイルのidは対応したものを記載する