![[PukiWiki]](image/header_title.png "[PukiWiki]")
#author("2021-06-01T04:38:29+00:00","","") #author("2021-06-01T04:39:58+00:00","","") [[MyMBGD]] #contents //------------------- // ゲノム登録方法 //------------------- * ゲノム登録方法 [#j91180c5] + MyMBGDのトップページの[Enter Your Data]をクリックします。 + [Create New Genome]をクリックします。 #ref(create_new_genome.png,left,wrap,create new genome,75%) + ゲノムの情報を入力し、[Save]をクリックします。 + [Create New Chromosome]をクリックします。 下記のタイプから選択できます。 - GenBank - GeneTab + ProteinSeq #ref(create_new_chromosome.png,left,wrap,create new genome,75%) + [参照]をクリックしてファイルをアップロードします。 //------------------- // 解析 //------------------- * 解析 [#n8bc4ab6] // ** Mapping to default ortholog group/Genomaple alnalysis [#l49568e9] *** 実行 [#s015a65f] + MyMBGDのトップページの[Execute Analysis]をクリックします。 + 方法を選ぶところで、「Mapping to default ortholog group/Genomaple alnalysis」を選択します。 #ref(analysis_mapping.png,left,wrap,create new genome,75%) + 解析条件を指定して[Execute Analysis]をクリックします。 *** 結果 [#g5463514] + MyMBGDのトップページの[Display Results]をクリックします。 + Dataで「Genomaple」を選択します。User genomeのリストのボタンよりデフォルトセットにアサインされたデータがダウンロードできます。 #ref(display_result_genomaple.png,left,wrap,create new genome,75%) + User genomeとGenomeを選択して[Show results]をクリックするとGenomapleの結果が表示されます。 #ref(genomaple_result.png,left,wrap,create new genome,75%) ** Clustering (Comparison of closely related species) [#r51b226e] *** 実行 [#qeb4fd05] + MyMBGDのトップページの[Execute Analysis]をクリックします。 + 方法を選ぶところで、「Clustering (Comparison of closely related species)」を選択します。 #ref(analysis_clustering.png,left,wrap,create new genome,75%) + 解析条件を指定して[Execute Analysis]をクリックします。 + 結果が表示されます。 #ref(clustering_result.png,left,wrap,create new genome,75%) *** 結果 [#kf1b60e6] + MyMBGDのトップページの[Display Results]をクリックします。 + Dataで「Clustering」を選択します。 それぞれのデータがダウンロードできます。 #ref(display_result_clustering.png,left,wrap,create new genome,75%)
