MyMBGD/データ解析
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Start:
[[MyMBGD]]
#contents
//-------------------
// ゲノム登録方法
//-------------------
* ゲノム登録方法 [#j91180c5]
+ MyMBGDのトップページの[Enter Your Data]をクリックします。
+ [Create New Genome]をクリックします。
#ref(create_new_genome.png,left,wrap,create new genome,75%)
+ ゲノムの情報を入力し、[Save]をクリックします。
+ [Create New Chromosome]をクリックします。
下記のタイプから選択できます。
- GenBank
- GeneTab + ProteinSeq
#ref(create_new_chromosome.png,left,wrap,create new genom...
+ [参照]をクリックしてファイルをアップロードします。
//-------------------
// 解析
//-------------------
* 解析 [#n8bc4ab6]
//
** Mapping to default ortholog group/Genomaple alnalysis ...
*** 実行 [#s015a65f]
+ MyMBGDのトップページの[Execute Analysis]をクリックしま...
+ 方法を選ぶところで、「Mapping to default ortholog group...
#ref(analysis_mapping.png,left,wrap,create new genome,75%)
+ 解析条件を指定して[Execute Analysis]をクリックします。
*** 結果 [#g5463514]
+ MyMBGDのトップページの[Display Results]をクリックします。
+ Dataで「Genomaple」を選択します。User genomeのリストの...
#ref(display_result_genomaple.png,left,wrap,create new ge...
+ User genomeとGenomeを選択して[Show results]をクリックす...
#ref(genomaple_result.png,left,wrap,create new genome,75%)
** Clustering (Comparison of closely related species) [#r...
*** 実行 [#qeb4fd05]
+ MyMBGDのトップページの[Execute Analysis]をクリックしま...
+ 方法を選ぶところで、「Clustering (Comparison of closely...
#ref(analysis_clustering.png,left,wrap,create new genome,...
+ 解析条件を指定して[Execute Analysis]をクリックします。
+ 結果が表示されます。
#ref(clustering_result.png,left,wrap,create new genome,75%)
*** 結果 [#kf1b60e6]
+ MyMBGDのトップページの[Display Results]をクリックします。
+ Dataで「Clustering」を選択します。 それぞれのデータがダ...
#ref(display_result_clustering.png,left,wrap,create new g...
End:
[[MyMBGD]]
#contents
//-------------------
// ゲノム登録方法
//-------------------
* ゲノム登録方法 [#j91180c5]
+ MyMBGDのトップページの[Enter Your Data]をクリックします。
+ [Create New Genome]をクリックします。
#ref(create_new_genome.png,left,wrap,create new genome,75%)
+ ゲノムの情報を入力し、[Save]をクリックします。
+ [Create New Chromosome]をクリックします。
下記のタイプから選択できます。
- GenBank
- GeneTab + ProteinSeq
#ref(create_new_chromosome.png,left,wrap,create new genom...
+ [参照]をクリックしてファイルをアップロードします。
//-------------------
// 解析
//-------------------
* 解析 [#n8bc4ab6]
//
** Mapping to default ortholog group/Genomaple alnalysis ...
*** 実行 [#s015a65f]
+ MyMBGDのトップページの[Execute Analysis]をクリックしま...
+ 方法を選ぶところで、「Mapping to default ortholog group...
#ref(analysis_mapping.png,left,wrap,create new genome,75%)
+ 解析条件を指定して[Execute Analysis]をクリックします。
*** 結果 [#g5463514]
+ MyMBGDのトップページの[Display Results]をクリックします。
+ Dataで「Genomaple」を選択します。User genomeのリストの...
#ref(display_result_genomaple.png,left,wrap,create new ge...
+ User genomeとGenomeを選択して[Show results]をクリックす...
#ref(genomaple_result.png,left,wrap,create new genome,75%)
** Clustering (Comparison of closely related species) [#r...
*** 実行 [#qeb4fd05]
+ MyMBGDのトップページの[Execute Analysis]をクリックしま...
+ 方法を選ぶところで、「Clustering (Comparison of closely...
#ref(analysis_clustering.png,left,wrap,create new genome,...
+ 解析条件を指定して[Execute Analysis]をクリックします。
+ 結果が表示されます。
#ref(clustering_result.png,left,wrap,create new genome,75%)
*** 結果 [#kf1b60e6]
+ MyMBGDのトップページの[Display Results]をクリックします。
+ Dataで「Clustering」を選択します。 それぞれのデータがダ...
#ref(display_result_clustering.png,left,wrap,create new g...
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